ต่อมาในปี ค.ศ. 1912 (พ.ศ. 2455) มีการจัดตั้งโรงเรียนคริสต์ศาสนศาสตร์ขึ้นอย่างอย่างเป็นทางการ โดยใช้ชื่อว่า “พระคริสตธรรมแมคกิลวารี” (McGilvary Theological Seminary) เพื่อเป็นเกียรติแก่ศาสนาจารย์ ดร.ดาเนียล แมคกิลวารี มิชชันนารีคณะอเมริกันเพรสไบทีเรียน ผู้บุกเบิกการประกาศคริสต์ศาสนาในล้านนา ต่อมาภายหลังได้เปลี่ยนชื่อเป็น “พระคริสตธรรมแห่งสภาคริสตจักรในประเทศไทย” (Thailand Theological Seminary)

ปี ค.ศ. 1979 (พ.ศ. 2522) พระคริสตธรรมฯ เข้าเป็นส่วนหนึ่งของวิทยาลัยพายัพอย่างเป็นทางการ โดยมีฐานะเป็น “คณะศาสนศาสตร์แมคกิลวารี” (McGilvary Faculty of Theology)

คณะศาสนศาสตร์แมคกิลวารีได้รับความเห็นชอบจากสภามหาวิทยาลัยพายัพ ยกฐานะขึ้นเป็น “วิทยาลัยพระคริสต์ธรรมแมคกิลวารี” (McGilvary College of Divinity) เพื่อเปิดโอกาสในการจัดการศึกษาด้านคริสต์ศาสนศาสตร์ให้กว้างขวางยิ่งขึ้น ในปี ค.ศ. 2006 (พ.ศ. 2549)

วิทยาลัยพระคริสต์ธรรมแมคกิลวารี มิได้เป็นเพียงการนับช่วงเวลาที่ยาวนาน หากแต่เป็นสัญลักษณ์แห่งความมุ่งมั่นในการสืบสานพันธกิจด้านการศึกษา การอบรมคุณธรรม จริยธรรม และความเชื่อทางคริสต์ศาสนา ตลอดระยะเวลากว่า 137 ปีที่ผ่านมา วิทยาลัยได้ทำหน้าที่เป็นแหล่งบ่มเพาะความรู้ ความคิด และจิตวิญญาณของเยาวชนไทย เพื่อเติบโตเป็นบุคลากรที่มีคุณภาพ เป็นประโยชน์ต่อสังคมและประเทศชาติ การครบรอบ 137 ปี จึงเป็นทั้งการระลึกถึงคุณูปการในอดีต และเป็นแรงบันดาลใจในการก้าวเดินสู่อนาคตอย่างมั่นคงและยั่งยืน